De warme, stimulerende werking van een hydrotherapiebad zet de hersenen aan tot de aanmaak van endorfine, het 'gelukshormoon'. De effecten zijn vergelijkbaar met die van morfine, maar dan zonder de bijwerkingen. Mensen voelen zich licht, kalm en ervaren zelfs een verhoogd gevoel van geluk tijdens hydrotherapiesessies, wat het gevolg is van de endorfine-werking.

Patiënten met hartkwalen, hoge bloeddruk of lage bloeddruk moeten extra voorzichtig zijn bij het gebruik van een hydrotherapie-spabad. De temperatuur van een hydrotherapie-spabad ligt meestal tussen de 36°C en 40°C. Baden in heet water kan vaatverwijding veroorzaken, wat leidt tot schommelingen in de bloeddruk.